Yûgi Muto, adolescent banal comme n’importe quel lycéen, mène jusque là une vie paisible.
Enfin comme un adolescent banal … il est bon de savoir qu’il a grandi et été élevé seulement par son grand père donc il n’est pas un enfant si normal que ça !
Grandissant dans un monde de jouets avec lequel le grand père de Yûgi Muto fait son commerce, un jour son grand père lui offrit un puzzle, appelé le puzzle millénaire, qui soit disant n’as jamais été terminé et renferme quelque chose de terrible.
Yûgi qui est on le remarque très spécial, arrive à compléter ce puzzle de forme de pyramide.
Alors que Yûgi est plutôt naïf et sympa, peut être même un peu trop, il devient tout à coup plus ténébreux, et dans des jeux bizarres, il devient le maître et commence à humilier ses adversaires en les écrasant et ne leurs laissant aucune chance.
Mais en dehors de ces jeux très spéciaux, Yûgi reste l’enfant paisible qu’il est en temps normal.
On se rend compte que c’est ce qu’on peut appeler une double personnalité, avec un certes, deux bon Yûgi mais un plus méchant et sérieux que l’autre.
Après que le grand père de Yûgi ai offert à son petit fils des cartes dont une très puissante (le Dragon Blanc aux Yeux Bleus) avec des étranges monstres dessus, pendant lequel Yûgi commence à devenir de plus en plus puissant, et se révèle avoir un énorme potentiel.
Le grand père de Yûgi se fait enlever par le célèbre et puissant créateur du jeu de carte auquel Yûgi joue, le jeu Magic & Wizards pour obliger Yûgi à allez sur l’île sur la quel est déroulé un tournoi de ce jeu de cartes.
Ce tournoi avec des duellistes venus de tout le monde, Yûgi devra essayer d’y vaincre, accompagné de ses amis, le maximum de duellistes pour arriver à son but, retrouver son grand père…